【神经遗传】脊髓小脑共济失调2型家系ATXN2基因中间重复病例表型与分子遗传学特征
文章来源:中华神经科杂志, 2022,55(1) : 21-26
作者:郝莹 段晓慧 金淼 王康 顾卫红
摘要
目的
探讨脊髓小脑共济失调2型(SCA2)致病基因ATXN2异常等位基因中间重复个体的表型和分子遗传学特点。
方法
针对2005—2018年中日友好医院神经科运动障碍与神经遗传病研究中心收集的1 383个常染色体显性遗传共济失调家系的先证者和部分家系成员,采用荧光标记毛细管电泳片段分析方法进行动态突变检测,对携带ATXN2基因中间重复的个体进行临床表型和遗传特征分析。
结果
共检出163个家系(包含先证者和家系成员共203人)携带异常扩展的ATXN2基因CAG重复序列,其中93个家系中有107例的异常扩展等位基因重复次数在29~34次之间。在其中的20个亲子对中,父系遗传16个,异常等位基因的代间扩展增加0~28次,母系遗传4个,异常等位基因的代间扩展增加0~4次。
结论
对于临床拟诊SCA2家系患者,需对其亲代或成年子代个体进行ATXN2基因检测,以免漏诊。动态突变基因检测有助于识别中间重复的个体,对明确家系致病基因和遗传咨询至关重要。
脊髓小脑共济失调(spinocerebellar ataxia,SCA)是一组主要累及脊髓、小脑、脑干等部位的神经系统退行性疾病,呈常染色体显性遗传,具有高度的遗传异质性和临床变异性[1, 2]。脊髓小脑共济失调2型(spinocerebellar ataxia type2,SCA2)表现为共济失调、慢眼动、腱反射减弱或消失、姿势性震颤等,其致病基因ATXN2定位于12q24.1,编码ataxin-2蛋白,由第1外显子内CAG三核苷酸重复扩展而致病。ATXN2基因的CAG正常重复范围是13~31次,异常重复次数>34次(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1275),介于两者之间的重复次数为中间重复。我们回顾性总结了携带ATXN2异常等位基因中间重复个体的临床资料,对其临床表型及分子遗传学特点进行细致分析。
资料和方法
一、临床资料
研究对象来自2005—2018年中日友好医院神经科运动障碍与神经遗传病研究中心收集的1 383个常染色体显性遗传共济失调家系先证者及部分家系成员。排除感染、中毒、缺血、代谢、免疫或肿瘤等继发性原因。
本研究为家系研究,经中日友好医院伦理委员会审批(批号:2013-39),所有受试者及其家属均签署知情同意书。
二、研究方法
1. 样本采集及基因组DNA的提取:在知情同意的情况下,采集患者及家系成员外周血5 ml,以质量分数为3.8%的枸橼酸钠进行抗凝,采用标准酚氯仿提取法提取基因组DNA。
2.聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)和琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物:根据ATXN2基因第1外显子CAG重复片段两侧序列设计引物,由北京赛百盛基因技术有限公司进行合成,正向引物序列:5′-TTTGGTAGCAACGGC - AAC-3′;反向引物序列:5′-CGGGCTTGCGGACA- TTGG-3′。PCR反应体系制备方法:依次加入脱氧核糖核苷三磷酸(dNTPs)2.50 mmol,2×GC缓冲液Ⅰ 12.50 μl,引物各5 pmol,模板DNA 100 ng,r-Taq 1 U,加灭菌去离子水补充至25 μl;反应条件为94 ℃预变性5 min,以94 ℃30 s、58 ℃30 s、72 ℃45 s,共循环35次,72 ℃延伸10 min。PCR扩增产物以质量浓度为3%的琼脂糖凝胶电泳,100 V电压电泳40 min,对于出现2个电泳条带的样本进行毛细管电泳片段分析。
3.基于毛细管电泳的片段分析:对上述电泳中出现2个电泳条带的样本进一步行毛细管电泳分析。采用荧光标记M13末端加尾法扩增ATXN2基因CAG重复片段,引物序列包括M13-反向引物(即反向引物5′端加M13序列,该序列为:5′-CACGACGTTGTAAAACGA-反向引物序列-3′)、经D4荧光标记的M13引物序列(为5′-CACGACGTTGTAAAAACGAC-3′,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成)以及上述正向引物。PCR反应体系为dNTPs 2.50 mmol、2×GC缓冲液Ⅰ 12.50 μl,正向引物3 pmol,M13引物3 pmol,带有M13序列的反向引物0.2 pmol,模板DNA 100 ng,r-Taq 1 U,加灭菌去离子水补充至25 μl。采用美国Beckman Coulter公司生产的CEQ-8000核酸分析仪对PCR扩增产物进行片段分析:取20 μl甲酰胺,0.25 μl CEQ DNA Size Standard kit-600片段作为标准内标,1 μl PCR扩增产物混匀后上样;预设程序进行电泳分离,分离条件为毛细管温度达50 ℃时,90 ℃变性120 s,2.0 kV电压下注入样本30 s、4.8 kV电压下电泳70 min,以预设的分析参数进行片段分析。
参考文献略